Séminaire R - Edition 3.0

16-18 Janvier 2019 - Faculté de Médecine de Lille

Les premières éditions du Séminaire R organisées depuis 2009 par le Dr. Chazard avaient été plébiscitées par les internes participants. En 2013 et 2016, cela avait été l'occasion d'inviter les internes de l'inter-région pour 3 jours d'initiation au logiciel de statistique R. Devant le succès rencontré par cet événement, nous sommes heureux de vous annoncer l'organisation d'une nouvelle édition 3.0. Cette nouvelle mouture sera destinée aux internes de tous niveaux et sera de nouveau ouverte aux internes de l'inter-région.

Une expérience préalable sur R ou en programmation sera l'occasion de se perfectionner en se tournant vers les exercices niveau avancé qui viendront systématiquement compléter le niveau débutant. L'objectif de ce séminaire est de vous guider à travers la réalisation d'une analyse statistique complète avec R. Les notions complexes de statistiques vous seront présentées d'un point de vue pratique et aucune connaissance avancée ne sera donc requise. Le format combinera la théorie et la mise en application immédiate sur vos machines. Les maîtres mots : pratique, pratique et (encore) pratique !

Les enseignements seront gratuits et dispensés par des médecins de santé publique expérimentés utilisant R au quotidien : Pr. Emmanuel Chazard (PU-PH), Dr. Jonathan Giovannelli (PH), Dr. Vincent Chouraki (MCU-PH), Dr. Grégoire Ficheur (MCU-PH), Dr. Alexandre Caron (AHU), Dr. Niels Martignene (internes de santé publique en fin de cursus).

Informations pratiques

Lieu des enseignements

Faculté de médecine de Lille

Pôle Formation - ED02 le 16 janvier 2019

Pôle Recherche - Salle du CERIM les 17 et 18 janvier 2019

 

Matériel

Connexion Internet : le paramétrage de votre connexion est impératif - veillez à consulter le tutoriel de connexion à EDUROAM. En cas de difficultés, rapprochez-vous des services informatiques de votre université.


Vous devrez vous munir de votre ordinateur portable avec son chargeur (pas de tablette) avec la dernière version de R installée. Vous devrez également avoir installé le logiciel R studio. Si vous rencontrez des problèmes d'installation, une session optionnelle est proposée le premier jour pour vous aider à les résoudre. Afin de respecter le programme, aucune aide complémentaire ne sera apportée ensuite et l'installation de R sera considérée comme effective.

La salle est équipée d'un vidéoprojecteur et de prises pour les ordinateurs.

Programme provisoire

Ce programme pourra être modifié.

Prérequis

  • Niveau en programmation : aucune connaissance en programmation n'est requise.
  • Niveau en statistiques : des bases en statistiques seront un plus.

Jour 1 (Mercredi 16 Janvier 2019)

  • 08.45-09.15 : Installation de R et Rstudio [*OPTIONNEL*] 
  • 09.00-09.15 : Accueil et Café.
  • 09.15-09.30 : Mot de bienvenue - Overview du séminaire 
  • 09.30-10.30 : Introduction au logiciel R : un logiciel de programmation
  • 10.30-10.45 : Stratégie de travail 
  • 10.45-11.15 : Structure des données dans R (1) 
  • Coffee break
  • 11.30-12.00 : Structure des données dans R (2) 
  • 12.00-12.45 : Indiçage dans R 
  • Lunch Break
  • 13.30-14.15 : Opérations sur les vecteurs et autres objets
  • 14.15-15:15 : Structure conditionnelles
  • Coffee break.
  • 15.30-16.15 : Boucles for et apply 
  • 16.15-17.15 : Programmation de fonctions

Jour 2 (Jeudi 17 Janvier 2019)

  • 09.30-11.00 : Chargement des données. Recodage des variables et datamanagement
  • Coffee break.
  • 11.15-12.45 : Statistiques univariées : paramètres et représentations graphiques
  • Lunch Break
  • 13.30-16.00 : Statistiques bivariées: paramètres, représentations graphiques et tests

Jour 3 (Vendredi 18 Janvier 2019)

  • 09.30-11.00 : Introduction aux analyses multivariées
  • Coffee break.
  • 11.15-12.45 : R pour le Big Data, introduction au Machine Learning 
  • Lunch Break
  • 13.30-15.00 : R pour l'épidémiologie
  • 15.00-15.45 : Perspectives : interactivité avec Shiny
  • 15.45-16.30 : Perspectives : rapport automatisé avec knitR
  • The End

Pour plus d'information, merci de contacter Mme. Bianco, secrétaire du Professeur Amouyel au 03 20 44 55 18 ou par l'intermédiaire de notre formulaire de contact.

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Maison Régionale de la Recherche Clinique du CHRU de Lille

6, rue du Professeur Laguesse

59037 Lille Cedex